鹿谷鄉公所隸屬南投縣政府，為鹿谷鄉最高行政機關，現置鄉長一人，綜理鄉務。鄉下設秘書一人，承鄉長之命，綜里公所事務。民政課、財政課、工務課、農經課、社會課為公所業務單位；人事室、政風室、主計室為幕僚單位；另設清潔隊、圖書館、托兒所、觀光服務所四個附屬機關，各單位克盡其職，協調分工，竭盡心力為鄉民服務。